La ECIMAT cuenta con tres tipos de espacios: zonas cedidas a grupos de investigación de la Universidad de Vigo (indicadas en color azul), zonas comunes a todos los usuarios (color verde) y zonas de servicio accesibles solo al personal de la estación (color naranja).
A continuación se muestra una lista de las instalaciones:
1. Laboratorio de oceanografía
2. Cultivos marinos 6
3. Cantina
4. Cultivos marinos 5
5. Cultivos marinos 4
6. Cultivos marinos 3
7. Laboratorio de microbiología
8. Laboratorio de bioseguridad
9. Pañol de buceo
10. Cultivos marinos 2
11. Cultivos marinos 1
12. Sala de microalgas 2
13. Sala de microalgas 1
14. Sala de zooplancto
15. Salas isotermas 1
16. Salas isotermas 2
17. Cámara 4ºC
18. Laboratorio de bioseguridad
19. Cámara -20ºC
20. Laboratorio húmedo
1. Laboratorio Polivalente
2. Almacén náutico
3. Laboratorio de investigación seco 2
4. Almacén 3
5. Laboratorio de investigación húmedo 2
6. Criosala
7. Laboratorio de investigación húmedo 1
8. Almacén 2
9. Laboratorio de investigación seco 1
10. Almacén 1
11. Oficina técnica
12. Unidad de cultivos marinos
13. Aseos
14. Coworking
15. Laboratorio seco
16. Sala de actos
17. Rincón de reflexión
1. Pantalán
2. Sala de bombas
3. Mesocosmos
