A ECIMAT conta con tres tipos de espazos: zonas cedidas a grupos de investigación da Universidade de Vigo (inficadas en cor azul), zonas comúns a tódolos usuarios (cor verde) e zonas de servizo accesibles só ao persoal da estación (cor laranxa).
A continuación móstrase unha listaxe das instalacións:
1. Laboratorio de oceanografía
2. Cultivos mariños 6
3. Cantina
4. Cultivos mariños 5
5. Cultivos mariños 4
6. Cultivos mariños 3
7. Laboratorio de microbioloxía
8. Laboratorio de bioseguridade
9. Pañol de mergullo
10. Cultivos mariños 2
11. Cultivos mariños 1
12. Sala de microalgas 2
13. Sala de microalgas 1
14. Sala de zooplancto
15. Salas isotermas 1
16. Salas isotermas 2
17. Cámara 4ºC
18. Laboratorio de bioseguridade
19. Cámara -20ºC
20. Laboratorio húmido
1. Laboratorio Polivalente
2. Almacén náutico
3. Laboratorio de investigación seco 2
4. Almacén 3
5. Laboratorio de investigación húmedo 2
6. Criosala
7. Laboratorio de investigación húmedo 1
8. Almacén 2
9. Laboratorio de investigación seco 1
10. Almacén 1
11. Oficina técnica
12. Unidade de cultivos mariños
13. Aseos
14. Coworking
15. Laboratorio seco
16. Sala de actos
17. Thinking corner
1. Pantalán
2. Sala de bombas
3. Mesocosmos